Dr. Ilir Sheraj | Western Balkans University
language-flag language-flag
APLIKO PËR BURSË
[email protected]

Dr. Ilir Sheraj

Lektor
Departamenti i Shkencave Kompjuterike
Fakulteti i Ekonomisë, Teknologjisë dhe Inovacionit
Bio
Edukimi
Publikime
Dr. Ilir Sheraj përfundoi doktoraturën e tij në Biologji Molekulare në Universitetin Teknik të Lindjes së Mesme (METU), ku u fokusua në kuptimin e ndryshimeve në metabolizmin e kancerit duke përdorur mjete bioinformatike dhe mësimin makinerik. Ky punim shënoi fillimin e udhëtimit të tij profesional në bioinformatikë dhe biologji kompjuterike. Pas diplomimit, Dr. Sheraj vazhdoi në METU si studiues postdoktoral përpara se të bashkohej me Universitetin e Ballkanit Perëndimor (WBU) si lektor në Bioteknologji dhe Biostatistikë. Më pas, ai u zhvendos në Spanjë për të punuar në Qendrën për Rregullimin e Gjenomit (CRG) si bioinformatikë, ku u specializua në trajtimin, përpunimin dhe analizimin e të dhënave të Sekuencimit të Gjeneratës së Re (NGS) për të kuptuar metabolizmin e tumorit, duke nxitur bashkëpunime me grupe kërkimore si në Spanjë ashtu edhe ndërkombëtarisht. Aktualisht, Dr. Sheraj është përsëri lektor në WBU, duke dhënë mësim në Biostatistikë, Bioinformatikë dhe Teknologjitë Omike. Si ekspert në analizën e të dhënave të mëdha, ai gjithashtu punon si freelancer, duke aplikuar teknika të avancuara të Mësimit Makinerik (ML) dhe Mësimit të Thellë në të dhëna komplekse biologjike. Ekspertiza e tij ndërdisiplinore fokusohet në integrimin e aplikacioneve të ML brenda të dhënave omike dhe konteksteve klinike, duke synuar të zbulojë njohuri të reja dhe përparime në mjekësinë e personalizuar. Dr. Sheraj beson fort në fuqinë e të dhënave, duke argumentuar se aftësia jonë për të kuptuar dhe kuruar sëmundjet varet nga aftësia jonë për të nxjerrë njohuri domethënëse nga të dhënat biologjike dhe klinike. Ai thekson rëndësinë e pajisjes së studentëve me aftësitë për të përdorur, përmirësuar dhe shpikur algoritme të reja, duke e parë këtë si çelësin për përparimin e fushës.
  • Middle East Technical University: Bsc, Hons (2011)
  • Middle East Technical University: Msc, Hons (2014)
  • Middle East Technical University: PhD, Hons (2021)
  1. Tunçer,S., Gurbanov, R., Sheraj, I., Solel, E., Esenturk, O., Banerjee, S. (2018). Low dose dimethyl sulfoxide driven gross molecular changes have the potential to interfere with various cellular processes. Scientific reports 8 (1), 14828.
  2. Torun,A., Enayat,S., Sheraj,I., Tunçer,S., Ülgen, DH., Banerjee, S. (2019). Butyrate mediated regulation of RNA binding proteins in the post-transcriptional regulation of inflammatory gene expression. Cellular Signaling 64, 109410.
  3. Tunçer,S., Sade‐Memişoğlu,A., Keşküş, AG., Sheraj,I., Güner,G., Akyol,A., Banerjee, S. (2019). Enhanced expression of HNF4α during intestinal epithelial differentiation is involved in the activation of ER stress. The FEBS Journal.
  4. Demirkol, SC., Seza, EG., Sheraj, I., et al. (2020). Evaluation of an aldo-keto reductase gene signature with prognostic significance in colon cancer via activation of epithelial to mesenchymal transition and the p70S6K pathway. Carcinogenesis, 41.
  5. Sheraj, I., Guray, TN., Banerjee, S. (2021). A pan-cancer transcriptomic study showing tumor specific alterations in central metabolism. Sci Rep 11,13637.
  6. Huebner,K., Erlenbach-Wuensch,K, Prochazka,J., Sheraj,I. et al.(2022). ATF2 loss promotes tumor invasion in colorectal cancer cells via upregulation of cancer driver TROP2. Cellular and Molecular Life Sciences.
  7. Ulusan,S., Sheraj,I., Stehling,S., Ivanov,I., Das,A., Kühn,H., Banerjee,S. (2022). Structural and functional evaluation of mammalian and plant lipoxygenases upon association with nanodiscs as membrane mimetics. Biophysical Chemistry.
  8. Pastorino,G., Sheraj,I. Huebner,K., et al (2024). A partial epithelial-mesenchymal transition signature for highly aggressive colorectal cancer cells that survive under nutrient restriction. The Journal of Pathology
  9. Gulec,E. et al. (2023). Nutrient depletion leads to major rewiring of endo-lysosomal signaling to enhance survival of cancer cells and drug resistance (Transport - Under review).
  10. Ghose et al. (2023). Mitochondria-derived nuclear ATP surge protects against confinement-induced proliferation defects (Under Review)
  11. Tiberti et al. (2024). Palmitate-induced mitochondrial damage restricts histone acetylation in CD8+ T cells to impair anti-tumor immunity. (Science Immunology – Under Review)